Органна музика Букстехуде мала ключове значення для переходу до сучасних органних стилів, і вона повністю використовувала технологію інструменту, що розвивалася. Його твори для органа містять як традицію вільних інструментальних форм (токкати та ін.), так і форму, засновану на духовній хоральній мелодії.
