Franz Liszt compôs sua Fantasia e Fuga sobre o tema BACH em 1855, e a revisou em 1870. Esta peça, escrita para órgão, está catalogada como S. 260i e S. 260ii (a versão original e a revisão de 1870, respectivamente). A peça foi estreada em 1856 por seu dedicatário, Alexander Winterberger, e publicada pouco depois. A segunda versão foi publicada por volta de 1872. Algum tempo depois, Liszt escreveu um arranjo para piano da peça, agora catalogado como S. 529, que se tornou amplamente conhecido. A obra original para órgão é agora uma peça de repertório.
Franz Liszt continuou a tendência de utilização do motivo BACH (embora claramente não numa linguagem barroca), que foi imensamente popular durante o renascimento de Bach na primeira metade do século XIX.
